La bataille n’est pas encore finie. Dans la foulée du transfert intégral de l’autorité de gestion des fonds européens à la Région, 30,25 postes devraient finalement être transférés par l’Etat pour gérer les fonds pluri-annuels FEDER (développement économique). 26,5 postes avaient d’abord été "créés" par le Conseil régional Midi-Pyrénées, fin 2013. Ils s’appuyaient sur la première estimation de l’Etat, jusqu’ici principale autorité gestionnaire. Le Conseil régional Midi-Pyrénées vient par ailleurs de créer 3 postes pour la gestion du FEADER, et 1 pour la gestion du LEADER.
Bien que ces dispositions soient encore provisoires, les services de la région et plusieurs observateurs notent que ces moyens sont en deçà, voire très en deça des besoins.
Avant transfert total aux Régions des fonds européens, le conseil régional employait déjà une trentaine d’agents chargés de la gestion et du suivi des dossiers européens. Côté Etat, une dizaine de personnes étaient employées au Sgar (Secrétariat Général aux Affaires Régionales - Préfecture), ainsi qu’une vingtaine de personnes réparties dans les départements.