La candidature de Montpellier, portée par 22 établissements de la région, n’a pas été retenue dans le cadre de la deuxième vague de l’appel à projets « Initiatives d’excellence ». Pour Bernard Hubert, directeur d’Agropolis et animateur du comité de pilotage Idex, « c’est une décision très lourde de conséquence. Les chercheurs, les labos et les étudiants iront dans les endroits qui sont reconnus et dotés de moyens importants. Je suis très inquiet à terme pour la région. Dans 10 ans Montpellier sera une université de seconde zone ». Les cinq projets pré-sélectionnés sont Aix-Marseille University Idex, Idex Lorraine, Idex Paris-Saclay, Paris Novi Mundi University et Université Sorbonne Paris Cité.