Elle est nommée secrétaire générale de la préfecture de l'Aveyron, sous-préfète de Rodez, en remplacement de Pierre Bressolles qui assurait l'intérim depuis le départ de Michèle Lugrand en avril. Depuis février 2019, Isabelle Knowles occupait la fonction de sous-préfète chargée de mission auprès du préfet de la région Bretagne, en charge du suivi des questions de cohésion sociale, lutte contre la pauvreté et l'habitat indigne, politique de la ville, développement des territoires ruraux, accueil et intégration des étrangers. La région Occitanie ne lui est pas inconnue puisqu'elle y a notamment occupé des fonctions de contrôleur de gestion au CHU de Montpellier (1990), de responsable du pôle cohésion sociale de la direction départementale des affaires sanitaires et sociales (2004) et, plus récemment, de directrice départementale de la cohésion sociale du Gard (2012-2019).
